使用这4个分支图生成器生成一个常见的树
你是否担心从表格设计分岐图制造者?以下是一些可以帮助你的分岐图制造者。
当我们还是孩子的时候,在生物学中我们都学过每个人在某种程度上都与彼此有关,比如猿类是人类的祖先,我们与食物链有关等等。
分岐图树代表了基于DNA序列、物理特征和表型的有机体之间的祖先关系。它是一棵进化树,允许人们根据相似特征、进化叙事和适应性对每个支系进行分类。最可能的假设是基于比较和绘制的分岐图来决定的。
它使用线条来表示与其他祖先或有机体群之间的支系方向。人们可以轻松地追踪线条到起始和结束的支系,代表假设的祖先。
如果需要的话,可以根据分子和形态水平使用行为数据(对于动物)将有机体分割。分岐图生成算法用于根据输入数据执行优化任务。目标是解决全局最小值问题,首选模拟退火方法,以确保得出最优解。
说到这里,这是一个人们可以选择的分岐图工具列表。
Creately
使用Cladogram制造者轻松可视化物种之间的关系。帮助有效识别和可视化系统发生关系。这是一种代表各种生物物种的绝佳方式,具有以下功能:
- 可导出为打印和共享的PDF、SVG和PNG图像
- 用于系统发育和分岐图的多个模板
- 在画布上轻松可视化关系
它提供了广泛的形状库,包括二分键、食物网、系统发育树和多个组织生物的模板。该工具提供简单的拖放功能,可以轻松创建关系,具有高级文本格式设置和可配置的颜色主题。
Creately提供拖放动物图像和动态连接器,可以无缝扩展、旋转和调整大小的图表。使用内置的谷歌图像创建动态分岐图,以集中研究数据,配备无限画布、通用全文搜索、内置工具和多功能表格。
使用实时光标、评论区进行讨论和视频会议,非常容易进行协作。
Insight Maker
Insight Maker是一种在Web浏览器中构建模型的简化形式。通过Insight Maker,人们可以轻松创建因果循环图和丰富图像,根据任何需求进行模拟。它有助于快速模拟人口互动并定义代理行为。
Insight Maker的使用非常简单:
- 在Web浏览器上启动工具,无需插件或下载
- 在画布上放置你的想法,创建模拟模型、丰富图像和见解
- 使用模拟算法开始代理模型和系统动态建模
- 与团队合作,并让他们向你发送设计输入
- 免费制作模型,发挥创造力的力量
此外,用户可以了解分岐图,并查看其他人正在进行的工作。这将帮助他们进行头脑风暴,找出最佳解决方案。
Guliford
使用SimpleClade和Cladistic Analysis,可以得到理想的分岐分析。它提供了一个图形用户界面,以设计古生物学课程中简单的工作方法。除此之外,该工具易于使用,只需安装软件,即可立即开始使用。
用户可以创建自己的CSV数据文件并开始生成支序图。使用该单元的整个过程包括可以快速学习的差异化价值。用户可以标记未使用的支类,并输入其他支类的值。
用户可以开始程序操作,并选择可以解释其查询的节点,如果需要,可以更改连接,计算最简统计量,连接外群的水平根茎,并查看特征状态变化。
IUBio
IUBio是另一个流行的工具,用于制作支序图、欧式图、弯曲图、表型图和树状图。它易于使用,上传树文件(或粘贴URL),提及标题,并提交详细信息。
用户还可以在IUBio中选择额外选项,以获得所需的输出,例如标签的基本URL、样式、字体、大小等。它还允许用户从树的生长和节点位置中选择,以使其看起来更好。
在线工具涉及多个方面,如节肢动物、DroSpeGe、enGenes、wFleaBase等等。它为生物信息学和分子生物学的用户提供公共访问。IUBio包括果蝇基因组、序列分析、生物序列转换以及任何用途的编辑器。
结论
基于树的支序图制作工具使人们可以用分支和核苷酸替代的遗传改变数量来表示进化谱系。还可以根据序列中的%改变来表示替代。
除此之外,在关注分支和节点(内部节点和外部节点-叶片和顶端)时,还需要保持树状结构。该图还包括分子钟来得出终极共同祖先。
开始使用支序图标记器以获得所需结果。